南無常住十方佛　南無常住十方法　南無常住十方僧（三稱）

願此香花雲　徧滿十方界　一一諸佛土　

無量香莊嚴　具足菩薩道　成就如來香

藥師贊：皈命滿月界　淨妙琉璃尊　法藥救人天　因中十二願 

慈悲宏誓廣　願度諸含生　我今申贊揚　志心頭面禮

淨身業真言：唵　修多利　修多利　修摩利　修摩利　莎诃

淨口業真言：唵　修利修利　摩诃修利　修修利　莎诃

淨意業真言：唵　縛日啰　怛诃賀吽

安土地真言：南無三滿哆　母馱喃　唵　度噜度噜　地尾莎诃

普供養真言：唵　耶耶曩　三婆縛　伐日啰吽

贊文:南無藥師會上佛菩薩（三稱）

蓮花花瓣安住八佛及經卷  迎請藥師七佛聖眾集海會  八大菩薩十六大士來圍繞　十二藥叉神將各領諸眷屬  大梵帝釋天王金剛力士等  土地龍神城隍諸護法　龍天八部護正法  助揚藥師法門得圓滿   普能利樂諸有情  同證如來無上道

一心皈命藥師海會  諸佛菩薩  祈請加持佛光照耀  除滅弟子眾等  無始貪瞋癡  以此修法所集  善功德  普皆回向  十方法界諸眾生  安住正道圓成佛智

祈請護法:

奉請大梵天王  奉請帝釋天王  奉請四大天王

奉請宮毗羅大將  奉請伐折羅大將  奉請迷企羅大將  奉請安底羅大將

奉請頞儞羅大將  奉請珊底羅大將  奉請因逹羅大將  奉請波夷羅大將

奉請摩虎羅大將  奉請真逹羅大將  奉請招杜羅大將  奉請毗羯羅大將

稱佛名號與十二大願:

南無本師釋迦牟尼佛（三稱）

南無藥師琉璃光如來（三稱）

南無藥師琉璃光如來本願功德經（三稱）

藥師琉璃光如來本行菩薩道時發十二大願令諸有情所求皆得

第一大願：願我來世得阿耨多羅三藐三菩提時，自身光明，熾然照耀無量無數無邊世界，以三十二大丈夫相，八十隨形，莊嚴其身，令一切有情，如我無異．

第二大願：願我來世得菩提時，身如琉璃，內外明徹，淨無瑕穢，光明廣大，功德巍巍，身善安住，焰網莊嚴，過於日月．幽冥眾生，悉蒙開曉，隨意所趣，作諸事業．

第三大願：願我來世得菩提時，以無量無邊智慧方便，令諸有情皆得無盡所受用物，莫令眾生有所乏少．

第四大願：願我來世得菩提時，若諸有情行邪道者，悉念安住菩提道中，若行聲聞獨覺乘者，皆以大乘而安立之．

第五大願：願我來世得菩提時，若有無量無邊有情，於我法中修行梵行，一切皆令得不缺戒，具三聚戒，設有毀犯，聞我名已，還得清淨，不墮惡趣．

第六大願：願我來世得菩提時，若諸有情，其身下劣，諸根不具，丑陋，頑愚，盲，聾，瘖，痖，攣，躄，背偻，白癞，顛狂，種種病苦．聞我名已，一切皆得端正黠慧，諸根完具，無諸疾苦．

第七大願：願我來世得菩提時，若諸有情，眾病逼切，無救無歸，無醫無藥，無親無家，貧窮多苦，我之名號，一經其耳，眾病悉除，身心安樂，家屬資具，悉皆豐足，乃至證得無上菩提．

第八大願：願我來世得菩提時，若有女人，為女百惡之所逼惱，極生厭離，願捨女身，聞我名已，一切皆得轉女成男，具丈夫相，乃至證得無上菩提．

第九大願：願我來世得菩提時，令諸有情，出魔羂網，解脫一切外道纏縛．若墮種種惡見稠林，皆當引攝，置於正見，漸令修習諸菩薩行，速證無上正等菩提．

第十大願：願我來世得菩提時，若諸有情，王法所錄，繩縛鞭撻，系閉牢獄，或當刑戮，及余無量災難凌辱，悲愁煎逼，身心受苦．若聞我名，以我福德威神力故，皆得解脫一切憂苦．

第十一大願：願我來世得菩提時，若諸有情，饑渴所惱，為求食故，造諸惡業．得聞我名，專念受持，我當先以上妙飲食，飽足其身，後以法味，畢竟安樂而建立之．

第十二大願：願我來世得菩提時，若諸有情，貧無衣服，蚊虻寒熱，晝夜逼惱，若聞我名，專念受持，如其所好，即得種種上妙衣服，亦得一切寶莊嚴具，華鬘塗香，鼓樂眾伎，隨心所翫，皆令滿足．

藥師偈：

藥師如來琉璃光　焰網莊嚴無等倫　無邊行願利有情　各遂所求皆不退

安住眾生於正道  悉皆成滿菩提願

南無東方淨琉璃世界藥師琉璃光如來（三稱）

南無藥師琉璃光如來（一０八）

南無日光遍照菩薩（三稱）南無月光遍照菩薩（三稱）

藥師灌頂真言：

那谟薄伽筏帝，裨殺社窭噜薜琉璃，缽剌婆喝啰阇也，怛陀揭多耶，阿羅诃帝，三藐三勃陀耶。怛侄阤：唵，鞞殺逝，鞞殺逝，鞞殺社，三沒揭帝娑诃

消解病咒：

唵　室哩哆　室哩哆　喗咤唎　娑诃(七遍)

解冤偈:

解結解結解寃結　解了多生寃和業　洗心滌慮發虔誠　今對佛前求解結　藥師佛藥師佛　無上醫王藥師佛　隨心滿願藥師佛

回向:

十二藥叉大將　助佛宣揚　五色彩縷其名　隨願悉圓成．寃業冰清　福壽永康寧　佛光注照○○○本命元辰　災星退度福星臨　九曜保長生運限和平福壽永康寧　

願此勝功德  普施諸眾生  四恩皆總報  三途定濟資   一切修法者

感應隨時現  佛陀正法興  廣利諸有情  一切弘揚者   圓證如來智